故事起源于28年前。

　　28年前，第一次外星人和地球人的正式接触发生了。但外星人的到来却引起了地球人的巨大恐慌，人类不敢相信这群外星人是善类，于是将他们专门放置到南非的贫民窟内便于管理，这个地方日后就成为了著名的第九区。

　　本片主人公是一名政府专员，他被派去负责驱逐外星人。谁知却因为一次意外而被感染，逐渐变成了一个外星人！变身之后他多方联络，希望能够政府给以救助，帮助他重返人身。可是政府只是将他当做一个实验品来研究，丝毫没有救助他的意思。他终于体会到了世态的炎凉，并决定自救……