拍摄过程中，导演成浩和主演柳云龙因为剧本发生过“艺术争论”。　
　　剧中柳云龙一人分饰两角并具有三个身份———日本间谍高桥浩以及跟他长得一模一样的共产党特工廖飞。　
　　《功勋》启用了多位俄罗斯人民演员（相当于中国的一级演员），日方高级将领板垣邀请了日本著名演员波多江青出演，全剧动用俄罗斯群众演员更是多达3000多人次。　
　　《功勋》请来《碟中谍》特技制作班底、执导过《喋血双雄》、《警察故事3》等片的香港著名特技导演罗礼贤挂帅。　
　　全剧开场演绎的苏军追杀日本间谍高桥浩父子的雪地枪战是剧组冒着黑龙江林海零下30度的严寒拍摄了12天才完成的。　
　　《功勋》尽全力做到最大程度还原当时的历史真实。选择哈尔滨拍摄，就是因为哈尔滨号称是“东方莫斯科”，有着浓郁的远东风情；服装也是专门从日本买来图书和资料，完全按照历史记载加工制作的“二战”时期的苏军和日军的军服和便服。　
　　为了还原当时的战争场面，在查阅大量历史材料和进行中俄两地的实地考察后，剧组搭建了“东林炮台”和号称亚洲第一的“丸一巨炮”，真实还原当时东北地区的东林要塞，仅“丸一巨炮”一个场景就花费30万元。　
　　而间谍活动中所使用的微型相机、发报机和专用刀具等等都是真实器具。