神盾局特工第二季背景讲述的是神盾局资深特工菲尔·科尔森来到执法机构神盾局组织了一支精锐、训练有素的特工小组，处理那些还未被指定为机密的案件：那些新的、陌生的、未知的东西。
　　这个小组包括：作战和间谍活动的专家Grant Ward、飞行员及武术专家Melinda May、不善与人交往的天才科学家Leo Fitz、生物和化学专家Jemma Simmons和潮涨组织的平民电脑黑客Skye。
　　故事中将会出现超级英雄、外星人和常人难以理解的现象，还有更多的动作、奇观和跨越世界的故事。剧情时而惊险，时而喜感十足。