韩国与朝鲜共同研制的核武器“飞击震天雷”决定转交给美国，朝鲜上校姜敏吉(金胜宇饰)对此不满，他绑架了核物理学博士金秀燕(孔孝珍饰)，又从研究所偷出核武器准备逃跑。韩国上校朴政宇(黄正民饰)去追赶偷走核武器的姜敏吉。
在一条小河上，双方对峙着。突然一颗每隔433年与地球相遇的特大彗星出现在他们头上。一阵龙卷风刮来，把他们一行人都刮的无影无踪。当他们清醒后，两队人马发现迎接
他们的竟然是女真族的斧头。原来，他们在彗星带来的龙卷风中，穿越时空回到了1572年。他们在混乱中使用了现代武器，把女真族人打跑了。这样，他们被当地人称为“天军”。
晚上，众人睡在一个山洞里，不知道怎么才能回到现在。祸不单行的是在他们熟睡之机，却被一个小偷把所有的武器给偷跑了。结果在抓小偷的过程中，还有两个人和小偷一起被抓进了监狱。险些丧命。逃出来之后，他们审问小偷，才知道小偷竟然是著名的朝鲜英雄李舜臣(朴重勋饰)。这时的李舜臣却一点也没有英雄样，他刚刚在武科考试中落榜，过着放荡的生活，对未来任何理想都没有。崇拜李舜臣的朴政宇显得非常失望，他要把李舜臣训练成真正的将军。同时，他们还要去找寻失落的核武器，还要保护当地的村民……
每件事情都进行的不顺利，李舜臣一点也不配合他们的训练，整天还是无所事事。并且，他们发现李舜臣是躲藏在这里贩卖人参；核武器的寻找进行的也没有结果；当地的村民还总受到女真人的骚扰……
终于，他们找回了核武器。李舜臣在一个小女孩被杀之后也激发了斗志，金秀燕还找到了回去的方法。但是，为了保护当地人，众人却要在去留上做出决定……洪剑/文
