巴西雨林里群鸟用美妙的歌声迎接一天的到来。主角阿蓝(Blu)刚出生，他感到一股要加入鸟群的悸动。然而，歌声被卡车的低吼打断。一张网子落在他的身上，他与其他鸟儿一同被装箱，塞进一架货机上…画面跳到美国明尼苏达州。一辆卡车驶过街道，当车子在冰上打滑，驾驶紧急煞车，滚落出一盒箱子。阿蓝就在里面。一名小女孩经过，救起了阿蓝。

　　15年后… 阿蓝与琳达(当年小女孩)同住。历经童年创伤，阿蓝仍不懂得飞翔，但他已学习帮琳达打理每日例行工作。一日，自巴西来的鸟类专家杜立欧现身书店，向琳达解释希望让阿蓝与珠儿这对濒临绝种的金钢鹦鹉配对。琳达终于同意随杜立欧到里约热内卢。

　　此时的里约正值嘉年华时节。杜立欧特别帮阿蓝打理一番，将他送进珠儿(Jewel)的围栏。珠儿唯一想法是逃脱。琳达与杜立欧误以为他们的争吵是真爱之鸣…决定让守卫席威欧(Sylvio)独自看护。然而席威欧却被一只白色鹦鹉叫耐久(Nigel)骗了而昏迷。耐久打开门让受雇于走私集团首脑马梭(Marcel)的男孩费南多(Fernando)绑架了阿蓝与珠儿。

　　走私者离开后，珠儿开始策划并逃脱，但被耐久看到了。阿蓝与珠儿因脚炼必须一致行动，但珠儿感觉被阿蓝拖累。幸好耐久追失他们。马梭注意到两只鸟儿不见了，命令耐久把他们抓回，并策划要把两只鸟儿偷运到机场。同时间，琳达与杜立欧已发现鸟儿不见并决定寻找他们。

　　森林里，阿蓝与珠儿遇见拉斐尔(Rafael)。拉斐尔认识一名叫鲁兹(Luiz)的家伙，能解开脚炼。同时耐久正胁迫一群贼猴帮他抓阿蓝与珠儿。男孩费南多此时良心发现要帮忙琳达与杜立欧寻鸟。途中，拉斐尔遇见旧识尼克(Nico)与派卓(Pedro)，群鸟于是到了一个俱乐部。整个俱乐部在拉斐尔进入时开始了一场森巴飙舞…直到贼猴闯入演变成大混战。阿蓝、珠儿、拉斐尔，还有尼克与派卓，于打斗中跳进一台前往鲁兹车房的手推车。经历波折，鲁兹终于阴错阳差地解开阿蓝与珠儿的脚炼。珠儿飞上天际，阿蓝深受打击，了解彼此不同。争论后，分道扬镳。不料耐久发现了珠儿并抓走她！阿蓝等立刻展开拯救。

　　琳达与杜立欧因跟踪马梭而到游行现场。花车指导把他们推入定位，害羞的琳达发现自己正处舞台中央。阿蓝终于发现珠儿，正要拯救她时，一面网子从天而降！ 阿蓝与珠儿双双落笼。透过费南多等的通风报信，琳达赶到并驾着花车猛撞走私者的飞机，却未成功。

　　幸好，强大的碰撞让阿蓝的鸟笼门锁撞落，他先协助群鸟飞出舱门但却打不开珠儿的笼锁。察觉骚动的耐久试图拦截阿蓝，却被吸入飞机的引擎。当飞机失控，走私者乘降落伞逃生。阿蓝尝试解救珠儿，突然耐久又不死心地出现。耐久把珠儿的鸟笼推落，阿蓝紧追在后，终于打开了门锁救了她一命。但当珠儿自由地飞翔，阿蓝却像石头般坠落。她开始唱歌，要他聆听心中的节奏。他终于在空中展翅高飞！琳达看到阿蓝，欣喜若狂并决定让他自由。

　　在丛林里，阿蓝与珠儿用歌声迎接新的一天的到来，随后他们可爱的宝宝也加入。他们在旅程中结识的好伙伴也都在这里。杜立欧与琳达乘着双人滑翔翼，大家都好快乐…除了耐久与走私集团，随着片尾谢幕字卡打出，我们终于看到他们以令人发噱的方式得到惩罚。

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