第一集
明朝宦官当道,大都恶贯满盈,国家饱经宦官摧残。掌舵东厂的都督王安与锦衣卫指挥使牛国栋表面上彼此尊重,实际则针锋相对。世袭锦衣卫的赵正目睹民间之惨况,决心为民请命。
内阁首辅叶向高之女儿叶敏因误会结识赵正,二人却情牵一线。嗜赌如命之魏进忠欠债逃亡,无意中助救太子,并得东厂都督王安赏识,自阉入宫为太监。
边境战况危急,瓦剌兵犯境,皇上却只派赵正率朱大典及张震三人作援军,三人带备工部尚书李友设计之『鹰之翼』、『火弩』、『连环弩』、『刺?甲』、『潜望镜』等新武器上阵。
第二集
赵正、朱大典及张震智勇兼备,凯旋归来,一战成名,皇上赐名『锦衣三剑侠』。皇上突然患上怪病,叶向高心感奇怪,加上黄太医离奇死亡,与对医药颇有学问之女儿商议后更觉事有蹊跷。叶藉调查此事,借意亲近赵正。
年幼的太子喜欢新奇事物,对李友设计之玩意甚感兴趣。一日偷走出宫时竟遇见叶敏,惊为天人。
第三集
赵正一干人等发现黄太医原是被人毒杀,调查中发现厂卫遗下的腰牌,上司牛国栋令三剑侠暗中查究,赵等人便由王安方便着手调查。
太子心系叶敏,终日闷闷不乐,魏进忠为讨太子欢心,介绍不同民间玩意。魏在宫中遇上容氏,百感交集。原来二人本为夫妇,惜当日魏为避债而拋妻舍子,现在容氏已为上司之妻,心感悔意。
调查皇上怪病一事苦无头绪,赵正怀疑事件与郑妃有关。神秘高手三番四次出现阻挠,原来是毒王霍星,赵正更被毒暗器所伤,幸得牛国栋及时相救。
第四集
赵正受伤,叶敏悉心照料,二人感情迈进一步。皇上怪病一事喜得线索,赵正从王安口中得悉事件与郑妃有关。
原来魏超勾结郑妃一伙,密谋毒杀皇帝,欲挟太子,垂帘听政。现在唯一没结党而可信赖之人便只有魏进忠。王安令魏进忠接近魏超调查真相,魏进忠得立功机会,亦欲与容氏发展地下情,欣然答允。
调查中,魏发现惊人秘密,原来幕后主脑正是锦衣卫指挥使牛国栋。朱大典、张震追捕之。
皇帝驾崩,太子与容氏被郑妃挟持于慈宁宫密室内,赵正前往营救。
第五集
大殿之上,皇太后以『国不可一日无君』为由,欲立郑妃之子继承皇位,叶向高等忠臣极力反对。太后定下两日时限,如未能找得太子回来登基,便依太后之决定。
牛国栋得悉事败,夺走武器仓库之『连环弩』及『百花匣』等犀利武器,决与赵正拼命。魏进忠虽相助,但赵不敌且形势危急。朱大典、张震赶至,成功营救太子及身受重伤之赵正。魏进忠乘混乱救出容氏。
两日时限已至,太后欲宣布郑妃之子登基时三剑侠及时赶至,叶向高立时义正严词地宣布太后及郑妃判国之罪。郑妃被捕,霍星突然出现,纠缠间霍星反中自己的毒器,后逃去无踪。