第三部：易水送别
荆轲向田光提出要离开杀手组织，田光久劝不下只好放他离开……
太傅蒙武看中了樊于期，欲招他为婿，其女蒙嫣想试一试樊于期的文采，故意派人送了一个木瓜给他，樊于期看出蒙嫣之意乃引自《诗经》中的《木瓜》一篇：投我于木瓜，报之与琼琚。匪报也，永以为好也。遂把派人把身上的玉佩送去给蒙嫣。二人心心相映，互托终身。
秦始皇水淹楚城造成大量伤亡，他派樊于期去攻打楚国最后一个城池。
蒙嫣送樊于期出城，二人依依惜别。
蒙嫣向樊于期许诺：妾拟将身嫁与，一生休，纵被无情弃，不能休。
樊于期带兵远去，蒙嫣追着马跑，夕阳下，二人的距离越来越远，越来越远，樊于期落在了队伍的最后，勒转马头回首，蒙嫣一滴泪缓缓地淌下……
樊于期来到楚国，看到逃难的百姓，回想起自己以前跟荆父他们一起逃难时的情景，不禁动了恻隐之心，他下令先让百姓离开再攻城，不想，百姓出来时脱下衣服全变成了兵，内外夹攻，秦军大败。
秦始皇得知这一消息时大怒，他命令樊于期三天之内赶回秦国，接受处罚，否则灭他九族，当樊于期带兵到达咸阳时，已过三日之期，秦始皇杀樊于期家将九族百余口人，樊于期亲眼看到亲人人头落地，心中悲愤万分，他被迫带部下杀出重围逃出秦国……
蒙嫣不顾父亲的反对历尽千辛万苦来和樊于期会合，但樊于期怕连累蒙家，留下了一封书信带着部下不告而别。
蒙嫣跑上山头追赶，却已经看不见樊于期的马队，伤心欲绝的她，握着樊于期送她的玉佩，泪如泉涌……
樊于期一行来到燕国，太子丹感激他曾在自己当质子逃离秦国时于己有恩，将他收留下来。
当时，秦国已经灭了七国中的赵韩两国，下一个目标一定是燕国，心急如焚的燕太子丹和召集田光等人一起策划"刺秦"行动，原来"天灭"组织是燕国派往各国探听情报，行刺要员的间谍组织，田光直属太子丹管辖，经过一番详细的考虑，田光向太子丹推荐了荆轲，太子丹乔装改扮，故意接近已改行在小饭馆当厨师的荆轲，但荆轲已立志不再杀人，一口拒绝了他的要求。
太子丹的妹妹芄兰公主，虽为女儿之身，却有男子的胆魄，她一心想揽下"刺秦"的任务，为燕国出一份力，但所有的人都认为荆轲比她合适。心中不服的芄兰公主女扮男装，多次作弄荆轲，想挫挫他的锐气，让太子丹对她另眼相看，结果，荆轲的锐气没有挫成，她自己反而陷入了情网，一发不可收拾……
太子丹三顾茅庐晓以大义，田光引剑自刎，以死相求，荆轲终于答应刺秦，但他有三个要求：一、 要铸剑大师徐夫仁打造的匕首，二、要燕国献出十五个城池的地图，三、 要樊于期的人头。太子丹毫不犹豫的答应了一切。
荆轲求徐夫仁为他打造一把削铁如泥的匕首，徐夫仁退隐已久，再加上当年曾发过誓终生不再铸剑，所以拒绝了他的要求，但当荆轲告诉他把这把剑是用来刺杀秦始皇时，徐夫仁回忆起二十年前，妻儿死于长平之战，报复心顿起，他答应为荆轲铸造匕首，荆轲为他燃炉，匕首--鱼肠炼成之日，徐夫仁祭炉而死……
荆轲前往拜访樊于期，两人像小时候一样比剑，喝酒，荆轲告诉他自己要去刺秦的计划，但他没法说出口，要用樊于期的人头来取信于秦始皇，但樊于期已经明白了他的来意，他告诉他："杀了一个秦始皇，还有千万个秦始皇，这并不能改变这黑暗的年代，但是，我说过，我欠你一条命，这辈子无论你让我作什么我都不会拒绝。"说完，樊于期一边喝酒，一边自刎，把自己的头割给了荆轲。
秦舞阳因杀人被判死刑，太子丹欣赏他力大无穷，胆大包天，欲让他作为荆轲的副使出使秦国，经过多方试探，秦舞阳虽不尽人意，但勉强可以过关，再加上时间紧迫，一时没有别的人选，在最后的一刻太子丹终于决定由秦舞阳出任荆轲的副使。
高渐离与荆轲重逢，他向他分析天下大势--秦始皇的统一大业并没有错，因为只有天下统一，国家才能避免战争，他要荆轲放弃"刺秦"的行动，但荆轲没有同意，因为他的肩上已经负担了田光，徐夫仁和樊于期三条人命，即使这一趟是错，他也得走，他告诉高渐离，这一刻他已经没办法再回头了……
赴秦的前一夜，芄兰公主来驿馆找荆轲，她告诉他自己是女儿身的秘密，并且向他表明了自己的爱意。
她知道荆轲此去，无论成功与否，都无法生还，所以向他提出在他出发前，和他成亲，为他留一个后。荆轲拒绝了她的好意，他告诉她，这个世界永远在重复同样的错误，与其留下后代让他们继续受苦，倒不如不让他们来到这个世界。
荆轲似乎已经预感到了他最终的命运，芄兰公主带着遗憾失望地离去……
燕太子丹全身素服，举行隆重的仪式，送荆轲和秦舞阳赴秦，岸边，高渐离一曲高歌：风潇潇兮易水寒，壮士一去兮不复还。水珠伴着琴弦来回跳动，当水珠落到河中，荡起一圈涟漪时，荆轲的小舟慢慢的划向河心……
高渐离一曲奏毕，长叹生平从此不会再有知已，把琴砸烂。
同一时间，城外的水月庵中，芄兰公主落发为尼，她把一头秀发洒入燕河上游，伴着荆轲的小舟缓缓向前流去。
荆轲一身白衣迎风而立，风吹拂着他的长发，使他显得衣衫翩然。小船慢慢的向金黄色的夕阳靠拢，渐渐地，渐渐地消失在河面上……
(字幕起)
荆轲在秦国大殿刺秦始皇，被殿内侍卫乱刀砍死，秦始皇佩服他是个英雄，下令厚葬，全国致哀。
(全剧完)
