第二十一集
林维源已经知道朝廷派人来查刘铭传的账，而此刻刘铭传依旧想着如何建设台湾办报纸，大家很是感慨。准备写万民信，求朝廷将刘铭传留在台湾。
邵友濂从各钱庄的账册上看到，所有的税款都投入到台湾铁路、煤矿、电报等多项
建设中。凭邵友濂的精明，已经看出，将来的台湾巡抚是一个欠债的封疆大吏。
回京后，他赶紧给朝廷上折，称赞刘铭传治台有方。
听说邵友濂上奏称赞刘铭传，左宗棠很是疑惑，决定亲自到台湾，当看到新番社的布局，左宗棠愣了，发觉和他在新疆军垦时的番社一模一样。濂花勇由衷地称赞刘铭传为民造福。左宗棠这才明白，自己一直错怪刘铭传了。临走将朱守谟交给了刘铭传。
刘铭传让朱守谟到帐房支上二十两银子回大陆去。朱守谟疚愧之极，不禁放声大哭。
左宗棠和李鸿章共同保举刘铭传为台湾巡抚。
刘铭传率领众官接旨，欢欣鼓舞，庆典建省。这时，刘璈提议他仍留在台南，巡抚衙门和兵备道台分南北而治。
刘铭传亲自到台南说服刘璈。刘璈恼羞成怒，刘铭传责问划地而治后刘清应在台南还是台北？刘璈终于理屈，答应建府台中，和刘铭传同城而治。
第二十二集
刘铭传和李彤恩来到基隆煤矿，下了矿井，才知道官吏所报的煤矿治理初见成效是个谎言。决定先用为刘璈修建兵备道台衙门的款项拿来开矿。
因日本间谍反复出现，刘铭传命人找来仓信敦，警告他，仓信敦反倒向刘铭传暗示，十年之后，日本必将成为台湾的主人。刘铭传愤怒之下，与他击掌为誓，与之打赌。
刘浤暗中获悉东瀛商社私营鸦片，就找到仓信敦，为了将他们的共同敌人刘铭传赶出台湾，他必须将其父刘璈扯进这趟混水里来。
仓信敦主动向刘铭传表示愿意资助开发煤矿，不计形式。刘铭传断然拒绝，面对仓信敦的威胁，刘铭传义正词严给予驳斥。
刘璈初次见到仓信敦就一阵嘲讽。仓信敦含蓄地对刘璈威胁利诱。只好答应帮助他们在台湾经营洋药(鸦片)。
刘淑婷跟踪烟民到一个烟馆，激愤地痛斥他们吸食鸦片。一怒之下叫刘朝带带领几个士卒来到，将烟馆里面砸得一片狼藉。
刘铭传奉劝刘璈告老还乡。刘璈自称就是死也要死在官位上，袍服而终。刘铭传斥他开烟馆将台湾弄得乌烟瘴气。
吴九溪又来烟馆寻找学生的父亲，烟馆伙计正在恐吓她。刘朝带让私贩鸦片罪犯的站笼停在烟馆门口，惹来众人围观。
第二十三集
刘璈的烟馆经不住刘朝带的反复闹腾，终于关门大吉，元气大伤。而眼下能帮他留在台湾的也只有左宗棠了，便亲自到百尺崖采摘血燕燕窝给左宗棠。
刘铭传让李彤恩核实沈应奎的履历，证实这是一个难得的人才，决定要重用他。
刘璈让沈应奎到福州在左宗棠跟前替他美言，刘璈在沈应奎临行前真情表白。
沈应奎却提出，湘军应该眼光放远，退让半步，这样才是真正给湘军挽回面子。左宗棠对他刮目相看。并说在刘铭传抗法保台之际，战前、战中、战后三参刘铭传，就是为了让其卸掉心上的包袱，大胆做事。
左帅认为台湾有了刘铭传，是台湾之幸，也是大清之幸。至于刘璈，也只能让他好自为之了。
左宗棠病逝福州。闽浙总督杨昌浚对刘铭传说，左帅遗言须在灵堂前问他，如何对待刘璈。刘铭传回答：忍。杨昌浚才同意资助台湾四十四万两银子。
上谕下来准许成立官脑局，允许筹资兴建海底电缆，但对于刘璈施政弊端一事却轻轻带过。刘铭传欲再次指名严参刘璈。李彤恩却建议他谨慎处之。
沈应奎告诉刘铭传，要参劾刘铭传。不料刘铭传接过折子撕得粉碎。并一语道破沈应奎想借机离开台湾这是非之地的原因。
第二十四集
刘璈已经接到旨意，要他进京待勘，他希望沈应奎留在台湾，保奏他为台湾兵备道台。
张厚和仓信敦秘密约见，训斥他在刘璈离职一事的不力及对滨田美穗(吴九溪)的开导不够，仓信敦表示，将极力补救。
圣旨已定，刘璈全家流徙宁古塔。因刘浤有残，赐回原籍养病。刘浤口称不敢奉旨，非要陪刘璈到宁古塔受罪，慈禧为刘浤的孝心感动，让军机处另拟新旨。
刘铭传接到军机处的廷寄，要他即刻交割，到京述职。他决定让李彤恩挑起建台的重担，和沈应奎携手共进。李彤恩声称刘铭传若被降旨或者不回来，他将去南洋经商，今生再不步入官场。
紫禁城，刘铭传和刘璈都在垂钓。
慈禧驾临，问两人垂钓有何感悟。刘璈说觉到皇恩浩荡。刘铭传说与世无争。慈禧要两人回到台湾，学会自处，为国效力。
李鸿章对刘铭传屡次三番参劾刘璈很是不满，刘铭传争辩一切为了台湾。
刘铭传回到台湾，编造谎话来给众人鼓劲。只是日本人仍在盗卖资源、倾销鸦片，一定要严加防范。李彤恩不以为然，刘铭传担心：恐怕十年后，中日之间将要有一场战争，谁胜谁负，就看这十年的比赛较劲了。
刘璈已经觉察到刘铭传要任用沈应奎，故意对沈应奎语言相激、试探。
刘铭传要保举沈应奎为台湾藩司，沈应奎顾忌刘铭传和刘璈之间的党同伐异之争再起，推说只想尸位素餐。刘铭传指出他当年因在税赋上一丝不苟才给撵出贵州。
第二十五集
杨昌浚来到台湾，并带来二十多名精通造枪、验枪、改枪的工匠。刘铭传刚要道谢，杨昌浚却苦笑着说此前答应每年给台湾四十四万两的协饷，不能给了，也不敢给了。
内务府打着为太后修建园子曾多次向杨昌浚索要银子未果，不料要资助台湾银子露了底，慈禧对此事很不满，出于多种考虑，杨昌浚再不敢给台湾协饷了。
沈应奎却认为，慈禧也未必就真的敢笑纳四十多万两银子，一番话让难过的刘铭传茅塞顿开。
慈禧听说杨昌浚要向她报效四十多万两银子，知道杨昌浚和刘铭传捏合一起来哄她高兴只好顺水推舟，将其赐予台湾。但对杨昌浚却落了个“罚俸一年”的处分。
发现掉进陷阱的毕乃尔，马莱诗媛以为又是法军，就将其关在圈养野兽的站笼里。刘朝带得知此讯马上赶来。因口气骄横。惹脑马莱诗媛，中了圈套，也被关进站笼。
刘铭传急忙赶来，受到番民的欢迎。刘铭传答应送给他们二十只火枪，并留下毕乃尔和刘朝代教习他们使用火枪。
李彤恩却忧虑他的藩社之行留下的隐患，刘铭传拿出朝廷要裁撤兵勇丁夫的抄件。为了台湾的长治久安，也为了警惕日本的虎视眈眈，他们必须藏兵与民，化民为兵。李彤恩这才明白刘铭传藩社之行的真实目的。
