清末，名闻天下的南湖楼惨遭书厄，孔家老太爷气绝身亡。在日本读书的孔家大少爷孔一白赶回来时，众书楼正落井下石，低价抢购南湖楼的书籍。孔一白怀疑是神秘偷书组织“落花宫”发誓报仇，与南湖楼同样名闻天下的风满楼也派出三少爷敖少方收书，却赶上一个叫云儿的姑娘斥责众人只图私利，孔一白与敖少方都深为触动，爱上了这个惊艳的女子……敖少方求父亲将云儿收留，正式嫁到敖家。却不知从此拉开了落花宫与风满楼的一段偷与藏的恩怨……
敖家两个孩子敖子书和敖谢天都对三婶的到来很惊奇。一个神通广大的黑衣人三次入楼遇险，都被藏在暗处的孩子救出，那黑衣人正是云儿！原来她便是落花宫的少主，父亲练落花诀走火入魔，临终前嘱咐务必将风满楼的孤本落花残卷偷出，那上面有牵系落花宫命运的文脉！而此时孔一白竟然也落靠到敖家，他想探明风满楼是否与落花宫勾结，偷了南湖楼的藏书。
云儿与敖少方相爱，生下了敖少方的儿子敖子轩，三叔敖少方因为掩护三奶奶真实身份中自家箭阵死去。十年后，谢天已练就了一身精湛内功。谢天和子书都对她倾心暗恋。茹月却深爱着谢天。大奶奶将茹月许给子书。子书喜出望外，谢天却悲痛不已，随归来的方文镜远走他乡。三奶云儿也奶毅然送儿子出国。
十年后的敖家落败，三奶奶云儿苦苦支撑，子轩带着在欧洲相识的女友雨童归国，给敖家带来一丝新气。一个神秘人出现，收购了敖家酒窖，酿出了比从前更美味醇厚的酒。敖家得到财力的支持度过难关。
落花宫重出江湖，偷得几大书楼怨声载道，周先生联合众书楼对落花宫进行围剿。而只有谢天和三奶奶明白，这一切都不是落花宫所为，倒底谁是罪魁祸首？三奶奶惊诧的发现周先生竟然就是当年的孔一白！周围几大书楼的丢书都同此人有关，孔一白是为复仇而来！三奶奶不寒而栗......
茹月爱上孔一白离开敖家，风满楼的声誉备受打击。，在孔一白的暗中设计下茹月将三奶奶排挤出敖庄，并揭露她落花宫的身份，三奶奶遭到敖庄人的唾弃。雨童为了唤醒众人的警惕，把爸爸偷运走的珍本救回，死在爸爸手下的枪口下。
方文镜传授给周先生以落花诀，使他走火入魔，方文镜等待他的自我毁灭，而三奶奶却伸手相助。谢天与茹月找回了当年的真情，两人企图一起浪迹天涯，却中了周先生设下的埋伏，死在了一起，三奶奶陷入极大的悲痛之中。
三奶奶唤起了已经准备臣服周先生淫威的几大书楼的人们，带着众人揭开事实的真相，将周先生所藏珍本找到，彻底破了周先生精心设计多年的复仇计划。周先生，也就是当年的孔一白被三奶奶废除了武功，也得到了心灵上的片刻安宁，当他得知女儿是死在自己手中时，心灰意冷，自尽身亡。敖庄恢复了从前的平静。
子轩去了北京寻找自己当年和雨童的梦想。领悟落花诀真谛的方文镜告别敖家，云游四海去了。而风满楼还静静的伫立在那，再没有偷与藏的传奇，子书整日在里面与书为伴，终成大学问家，三奶奶守候在那里……
