第14集
老吉请神甫吃了一顿美味佳肴，神甫回去便上吐下泻。神甫把状告到知府，但食物中却查不出半点有毒物质，。赖红姑终于弄清，佟鹤龄便是当年杀害父亲的万道台。红姑提剑前往佟鹤龄住处，决定报仇雪恨，不料，正碰上木蝴蝶与佟鹤龄相认。老吉几经试验，终于摸索到戒毒良方，成立了戒烟馆。佟鹤龄答应木蝴蝶留下，他也打算把南洋的产业搬到庆州
来，叶落归根，安度晚年。
第15集
老吉突然接到懿旨，让其顶替太医刘洪到紫禁城做御医。老吉摸不清底细，托病敷衍。赖红姑得知后，答应陪同老吉一同前往。因为她调查清楚万道台也是受人指使，她要把杀父的真正元凶查出来。到了京城，老吉一行被安置在皇城根的一个四合院里，等待太后召见。老吉带着两个徒弟上街，看到什么都觉得新鲜。孔笙在路上碰到一个绝色女子，原来她是从宫中跑出来幽会情人的七格格。
第16集
慈安对慈禧召土郎中老吉进京颇为不解，她从骨子里看不起这个乡下土郎中。慈禧决定当场考考老吉。慈禧又让老吉为自己和慈安悬丝诊脉。慈安让七格格替她躺入帐中，老吉摸着摸着，竟虚脱晕倒。原来，老吉在诊脉时发现了喜脉，他惊恐难言，只好耍了个花招。这件事引得慈安一阵嘲笑。顺亲王却从中看出破绽，把老吉接到府上了解情况，老吉不敢直言，恳求顺亲王放他回岭南，顺亲王没有答应。
第17集
慈禧发现七格格有反胃呕吐症状，宣老吉进宫为七格格诊脉，老吉再次被吓个半死，原来七格格也是喜脉。赖红姑替老吉去给七格格送药，从七格格嘴里得知，她那天为慈安当替身的事。老吉给七格格开一服打胎药，也请七格格在太后面前说好话，放他们回岭南。慈禧考虑到慈安对老吉的反感，决定放老吉回去，临走前让老吉开一些养颜美容的药方，赖红姑利用这个机会，写了一张特殊的“药方”，引发了慈禧的兴趣。
第18集
慈安突然病了，且病势越来越重。慈禧宣老吉为慈安看病，老吉开出一张虎狼药方，太医院的人不敢依方抓药，结果，慈安的病非旦没有好转，反而危在旦夕。老吉因此被绑，就在准备行刑时，赖红姑闯入宫中，弄清了事情真相，救了老吉。慈安因殆误时机，已病入膏肓。老吉提出，要救慈安，必须用慈禧的血，慈禧慨然允之。老吉被御封为太医院院长，官至五品。两宫太后同时赐与红姑一枚进宫腰牌，可随时到后宫行走。
第19集
老吉半夜穿上官服起来臭美，被赖红姑看到，奚落一番。老吉到太医院去上班，和那些照本宣科的老夫子太医格格不入。贺天章听说老吉在京城当了官，千里迢迢从岭南赶来，希望借助老吉的外力发大财。老吉在请贺天章吃饭时，偶遇李莲英。善于投机钻营的贺天章靠吹牛拍马，送礼行贿等手段，讨得李公公欢喜。贺天章仗着李公公的关系，盘下了专门为太医院供药的“济世堂”大药房，更名为“济生堂”，并举行了隆重的揭幕仪式。
第20集
老吉街上邂逅刘洪，刘洪暗示老吉当晚后海湖边说话，但刘洪已被人灭口。顺亲王再次安排杨小云所有的戏班子进宫为两宫太后唱堂会。戏演了一半，扮做戏子的杀手突然向慈禧射出毒箭，幸亏杨小云及时用枪挑开。戏班所有的人都被抓进了大牢，杨小云临刑前，被李莲英拿着慈禧的懿旨救下，杨小云感激慈禧救命之恩，愿为慈禧收集顺亲王篡权谋反的证据。
第21集
顺亲王决定利用赖红姑的复仇心理，故意制造出一些假象，使赖红姑愈发坚信，当年杀害父亲的祸首就是慈禧。孔笙告别了老吉，决心在官场上干出一番轰轰烈烈的大事业。顺亲王为两宫太后进献了一张民间祖传的延年益寿药方，李莲英将药方交给老吉，让他亲自熬制，直接送给两宫太后服用。孔笙做了九门提督副都统后，深得市民的赞颂，也让木蝴蝶刮目相看。
第22集
贺天章深得李莲英的赏识。李公公专门为他借来了二品官服官轿。正当贺天章忘乎所以时，被孔笙撞见捉拿归案。孔笙得知始作俑者是李莲英，也将李莲英捉起来。顺亲王将此事报告两宫太后，慈禧虽恨得咬牙切齿，但也不便发作。孔笙拿着小皇上奖励的金锏去向老吉和木蝴蝶炫耀，老吉告诫孔笙，官场险恶，让他不要太张扬，要谨慎从事，遇到孔笙的讥讽。
第23集
慈安太后在没有任何疾患的情况下突然暴毙。顺亲王诱导老吉把陷害慈安的罪名扣在慈禧头上，老吉不从。顺亲王让贺天章在慈禧的药里下毒，此事被杨小云发现，将下毒的药液打翻。顺亲王对老吉软硬兼施，希望老吉做伪证。老吉不肯，顺亲王恼羞成怒，决定让孔笙把老吉打入天牢。孔笙昧着良心把师傅抓走，同时把贺天章也捎了进去。
第24集
赖红姑恳求顺亲王网开一面，顺亲王把责任全部推到慈禧身上，愈发激起了赖红姑内心的仇恨。慈禧部署亲信为顺亲王挖下陷阱。老吉用药使贺天章诈死，侥幸逃命。赖红姑去大牢看望老吉，第一次向老吉倾吐了爱慕之情。赖红姑当晚进宫刺杀慈禧。谁知，慈禧早有预料，反将赖红姑擒获，慈禧告诉赖红姑，真正杀她父亲的祸首就是顺亲王。
第25集
慈禧让李公公到天牢里解救出老吉，并把顺亲王骗进宫来。顺亲王以为慈禧真的被赖红姑刺伤，不料却中了慈禧的圈套。慈禧要奖赏老吉，老吉坚决要求回岭南，被慈禧获准。赖红姑被慈禧封为红格格。老吉、孔笙、木蝴蝶从此结束了宫廷的荣华富贵和惊心动魄，离开了京城。老吉带着木蝴蝶和孔笙回到自己的药铺，想不到药铺早已被贺天章变卖。（待续）
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